時は天保14年。
マシュー・ペリー提督の黒船が来る10年前の江戸の町では、異界から骨肉を持った獣「妖夷」（ようい）が出没し、人々を襲っていた。
それに立ち向かうのは、「蛮社改所」（ばんしゃあらためしょ）と呼ばれる組織に属する、「奇士」（あやし）と呼ばれる者であった。